六月，两畿、山东、河南大旱蝗灾。
九月，陕西、山西旱饥。清军第四次入塞，扫荡畿南、山东。
十月，李自成部遭明军围剿，损失惨重，仅余十八人。
崇祯十二年（1639年）
正月，清兵侵入济南，德王朱由枢被俘。
五月，张献忠在谷城再次叛乱，罗汝才等响应，攻陷房县。
六月，畿内、山东、河南、山西旱灾蝗灾。
八月，任命大学士杨嗣昌督师讨伐农民军，总督以受节制。
崇祯十三年（160年）
正月，赈济京师、山东灾民。
二月，总督陕西三边侍郎郑崇俭大破张献忠于太平县之玛瑙山，张献忠败走归州。
九月，陕西明军围李自成于巴西鱼腹山中，李自成突围而去。
十一月，杨嗣昌进军重庆。南京地震。
十二月，李自成自湖广进入河南，灾民归附，连克宜阳、永宁、偃师，民声势大盛。
是年，两畿、山东、河南、山西、陕西旱灾蝗灾，人相食。
崇祯十四年（161年）
正月，李自成攻克洛阳，福王朱常洵遇害。
二月，李自成进攻开封，周王朱恭枵、巡按御史高名衡坚守，将农民军击退。
四月，清兵进攻锦州，祖大寿坚守。
六月，两畿、山东、河南、浙江、湖广旱蝗，山东寇起。
七月，洪承畴驰援锦州，驻师松山。京师发生瘟疫。
八月，明清松锦决战，明军大败，主力部队大部被歼，蓟辽总督洪承畴等被迫困守于松山、锦州等城中。
九月，张献忠部屠项城、商水及扶沟。
十一月，李自成克南阳，唐王朱聿镆遇害。
十二月，李自成连克洧川、许州、长葛、鄢陵。
崇祯十五年（162年）
正月，任命孙传庭为兵部侍郎，督京军救援开封。
二月，清兵攻克松山，洪承畴降清。
三月，祖大寿在锦州降清。李自成克睢州、太康、宁陵、考城。
五月，张献忠攻陷庐州。
九月，李自成部决黄河灌开封，军民溺死者数十万人。
十一月，发帑银赈济开封遇难宗室军民。清兵分道入塞，京师戒严。
闰十一月，下诏罪己，求直言。清兵南下，畿南郡邑多被攻陷。
十二月，李自成攻占襄阳，后分兵下德安、彝陵、荆门，攻陷荆州，焚献陵。
崇祯十六年（163年）
二月起，京师发生瘟疫，发帑银治疗。
三月，李自成杀罗汝才，并其众，攻陷武冈，杀岷王朱企昪。
九月，张献忠陷宝庆。凤阳地震。
五月，张献忠部克武昌，杀楚王，建立“大西”政权。
十月，李自成攻陷潼关，督师尚孙传庭战死。李自成部连克华州、渭南、临潼，屠商州。李自成部攻陷西安，秦王朱存枢投降。
十一月，李自成攻陷延安，屠凤翔。宁夏、庆阳相继被攻陷。
崇祯十七年（16年）
正月，李自成在西安称帝，建国号“大顺”。随即分兵两路向北京进军。凤阳、南京地震。
二月，李自成攻陷太原，俘晋王朱求桂。下诏天下勤王。
三月，李自成兵临京师，京营兵溃败，十九日崇祯帝崩于万岁山，王承恩从死。
御衣襟曰：“朕凉德藐躬，上干天咎，然皆诸臣误朕。朕死无面目见祖宗，自去冠冕，以发覆面。任贼分裂，无伤百姓一人。”
……
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